Todas las actividades desarrolladas responden a los objetivos específicos del Centro Ecológico que a su vez se enmarcan dentro de los programas del Plan de Manejo del Refugio de Vida Silvestre los Guatuzos, respondiendo de esta forma a una estrategia regional de manejo de las áreas protegidas del Sureste de Nicaragua.

Las temáticas desarrolladas por el Centro Ecológico han sido:

-Atención de Investigadores y visitantes.
-Monitoreo ambiental.
-Protección y control.
-Promoción del ecoturismo.

La existencia del Centro ecológico ha permitido la ejecución de algunos programas y subprogramas establecidos en el Plan de Manejo del Refugio de Vida Silvestre los Guatuzos, entre estos:

-Programa de desarrollo sostenible.
   -Subprograma de ecoturismo.
   -Subprograma manejo de vida silvestre.
-Programa de gestión y seguimiento.
   -Programa de investigación.
   -Programa de educación ambiental y capacitación.